一九六一年德島縣出生，日本女子大學畢業。曾任職出版社，又再進入東海大學醫學院就讀，成為醫生。
二〇一六年以《安寧的祝福》踏入文壇。目前在東京都內末期醫療專門醫院擔任內科醫生。
二〇一八年，南杏子於NHK節目談論如何迎接生命的終結，引發熱烈迴響，之後發行的《安寧的祝福》文庫版也躍升為暢銷書。
其探討安樂死與臨終醫療之作《生命停止處》（暫譯）已改編為同名電影，由吉永小百合、松坂桃李、廣瀨鈴主演，並於二〇二一年在日本上映。
另著有《親愛的病患　情誼病歷》（暫譯）等作品。