財團法人臺北動物園保育教育基金會成立於1999年1月，主要目的是結合動物園資源及民間力量，推展野生動物的保育與教育、研究及發展工作，希望能達到：在動物福利方面，協助動物園改善不合宜的圈養環境，並提升展示品質；在自然保育方面，應用動物園現有資源及經驗，推廣有利於保育的行動；在全民教育方面，利用動物園的魅力及知名度，對民眾進行正確的保育教育和野生動物的知識教育。